Своевременная диагностика – залог хорошего урожая

Авторы: Ирина Борисова, заведующая лабораторией СЗР ООО НБЦ «Фармбиомед»; Ольга Тихомирова, генеральный директор ООО НБЦ «Фармбиомед»

Своевременная и правильная диагностика инфекционных болезней растений – залог хорошего урожая. Эта аксиома известна каждому агроному. Но не так просто бывает определить причину потерь без использования специальных методов. Уж очень «мастерски» некоторые коварные возбудители маскируют следы своего присутствия под физиологические изменения вследствие нарушений температурного или водного режима, баланса питательных веществ, инфицирования патогенами другой группы и пр. В таких случаях для выбора правильной стратегии защиты необходимы детальные исследования предполагаемых источников инфекций (семян, смывов с конструкций, воды и водных растворов, субстратов и пр.), растительного материала.

Именно для этих целей была создана испытательная лаборатория «АгросервисДиагностика», которая уже более 15 лет помогает агрономам выявить причину нарушений, чтобы защитные мероприятия были эффективны. Для этого лаборатория располагает всеми основными на сегодняшний день методами идентификации фитопатогенных бактерий (в том числе фитоплазм), грибов, вирусов, вироидов.

Испытательная лаборатория осуществляет свою деятельность

в соответствии с требованиями ГОСТ ISO/IEC 17025-2019 «Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий», которая направлена на: обеспечение достоверности, объективности

и требуемой точности результатов испытаний; создание необходимых условий для проведения исследований (испытаний) продукции, в том числе обеспечение ресурсами; своевременную передачу заказчикам информации

о результатах выполненных работ в виде протоколов испытаний и/или других необходимых документов о результатах лабораторной деятельности. Кроме того, в лаборатории организован строгий контроль за качеством проводимых исследований, который предусматривает ежедневный контроль, проводимый ответственным исполнителем исследований, внутрилабораторный контроль качества между исполнителями, проведение внутренних аудитов, ежегодный анализ рисков. 

За последние двадцать лет микробиологическая диагностика совершила огромный скачок от ручных методик до полностью автоматизированных этапов исследований. Использование в нашей лаборатории комплексных исследований как классическими микробиологическими, так и высокоточными серологическими (ИФА) и молекулярными (ПЦР-РВ, LAMP) (рис.1) методами выделения и идентификации позволяет выявить полный комплекс фитопатогенных бактерий и грибов в исследуемом образце. 

Для каждого поступившего образца подбирается определённая программа исследований с учётом проявленных симптомов и задач Заказчика. Выявленные инструментальными методами ИФА, ПЦР, LAMP микроорганизмы далее высеваются на питательные среды для определения их жизнеспособности. Особенно актуально это для образцов смывов с конструкций теплиц после проведения дезинфекционных мероприятий или растительных образцов после применения схем защиты, так как высокая чувствительность этих методов, особенно ПЦР, позволяет выявить специфические для искомого вида патогена участки ДНК или РНК даже после его гибели. В то же время идентифицированные классическими методами с помощью селективных питательных сред бактерии порой требуют подтверждения видовой принадлежности методом ПЦР.

Что касается выявления вирусных болезней, то на данный момент визуальное определение присутствия возбудителя или попытка отнести проявленные симптомы к какому-либо виду, с учётом их способности к мутациям и разнообразию проявлений, вообще могут завести в тупик. Идентификация вирусных возбудителей возможна только иммуноферментным и молекулярным способами.

Для успешной работы в тепличных комплексах необходимо не только своевременно выделить возбудителя, но и найти причину возникновения и, главное, пути устранения проблемы. Поэтому большое внимание производители сельхозпродукции уделяют проведению основного профилактического мероприятия в ТК – дезинфекции теплиц между оборотами. И здесь неотъемлемой частью этого комплекса становятся контроль качества – визуальная оценка выполненных работ, особенно в «укромных местах» стыков и сложных поверхностей, и отбор смывов. Результаты анализов смывов после дезинфекции, проведённые в лаборатории «АгросервисДиагностика», выявляли в отдельных случаях наличие возбудителей: Fusarium oxysporum, Fusarium solani, Alternaria alternata, Pectobacterium carotovorum, Agrobacterium tumefaciens. Реже обнаруживаются вирусы. Это позволяет ещё до начала оборота устранить очаг возникновения инфекции.

Серьёзно стоят вопросы и с поливной водой. В целом можно сказать, суммируя итоги исследований образцов поливной воды, что в ней содержатся почти все основные возбудители грибных, бактериальных и вирусных болезней. Конечно, наиболее опасны в этом отношении воды из открытых водоёмов и возвратный дренаж, но и в воде из скважин в ИЛ «АгросервисДиагностика» был выделен вирус томатной мозаики (ToMV).

Не стоит забывать и про латентные инфекции. Периодическая проверка вегетирующих растений с опасным симптомом «Всё хорошо» позволит вовремя принять меры и избежать неожиданных потерь, которые могут оказаться весьма ощутимыми.

За годы работы лабораторией накоплен немалый материал по фитосанитарному состоянию в теплицах. Из грибных патогенов в корнях и стеблях томата и огурца, как всегда, лидируют грибы рода Fusarium, регулярно встречаются грибы рода Verticilium, Cylindrocarpon destructans, на томатах Boeremia lycopersici (syn. Ascochyta lycopersici), значительно реже в корнях в 2025 году стал встречаться Pythium debaryanum, который создавал немало проблем на различных культурах, на листьях томата выделяется Cladosporium cladosporioides.Несмотря на то, что многие комбинаты достаточно эффективно применяют интегрированные схемы защиты от «бешеного корня» (рис.2), бактерии рода Agrobacterium по-прежнему часто встречаются в защищённом грунте на огурцах, розах, томатах, принося первым двум наиболее ощутимые потери. 

Однако, в 2025 году ИЛ «АгросервисДиагностика» столкнулась с проблемой, когда возбудителем некроза сердцевины стебля оказалась другая бактерия рода Pseudomonas - Pseudomonas mediterranea. Ps. mediterranea была известна в Европе с начала двухтысячных годов, но до этого времени в РФ выделена не была. Обе бактерии вызывают похожие симптомы, однако признаки поражения Ps. mediterranea проявляются в более ранние сроки – в начале цветения, в то время как при поражении Ps. corrugata симптомы обычно проявляются в фазе плодоношения первых кистей. Исследование образца с некрозом сердцевины выявило наличие не только вышеназванной псевдомонады. Причиной увядания и последующей гибели растений служил целый комплекс, включающий Clavibacter michiganensis и Fusarium oxysporum.

За последние годы произошли изменения в составе фитопатогенных вирусов. Всем известно проникновение на нашу территорию вирусов пепино (PepMV) и коричневой морщинистости плодов томата (ToBRFV). Оба патогена внесены в списки карантинных объектов. Но и вирусы не являющиеся карантинными могут приносить ощутимый ущерб. В образцах, поступающих в лабораторию, зачастую выделяются комплексы вирусных возбудителей, насчитывающие от 2 до 5 видов (рис.4). 

В целом, обращает на себя внимание, что при проявлении каких-либо отклонений в развитии растений из образцов выделяются целые комплексы патогенов, содержащие самые разные комбинации возбудителей: бактерии и грибы, бактерии, грибы и вирусы и т.д.

Наш многолетний опыт работы, опирающийся на данные отечественных и зарубежных исследований, сформировал некоторые определённые подходы к отбору образцов и проведению исследований, которые мы отразили в «Методике отбора образцов». Использует лаборатория и авторские методики, проверенные многолетними испытаниями.

Такой арсенал даёт нам возможность исследовать не только наличие и видовую принадлежность патогенов: неоднократно обращались к нам и для оценки разрабатываемых биопрепаратов или биопрепаратов с истекающим сроком годности.

В лабораторию обращаются как крупные сельскохозяйственные производители, так и небольшие фермерские хозяйства. Неограничен у лаборатории и спектр диагностируемых растений: овощные культуры открытого и защищенного грунта, плодовые, технические, цветочные, декоративные культуры. Специалисты лаборатории могут также оказать помощь в определении насекомых и клещей фитофагов, энтомофагов, нематод.

Современная диагностика растений является основой эффективной системы защиты сельскохозяйственных культур. Своевременное выявление возбудителей болезней, определение их видовой принадлежности и оценка фитосанитарного состояния агроценоза позволяют принимать обоснованные решения по выбору методов защиты растений, снижать потери урожая и повышать эффективность проводимых мероприятий.

Лаборатория постоянно совершенствует применяемые методы исследований, расширяет перечень диагностируемых объектов и внедряет современные подходы к анализу фитосанитарных рисков. Мы стремимся обеспечить сельхозпроизводителей достоверной и оперативной информацией, необходимой для сохранения здоровья растений и получения качественной продукции